非典型猪瘟则采集组织脏器(如扁桃体 、淋巴结等)和血清送到有条件的实验室进行诊断和鉴别 。临床上出现以高热 、皮肤出血等败血症为特点的急性猪瘟时 ，应注意与急性猪丹毒 、最急性猪肺疫 、败血性链球菌病 、急性猪副伤寒和弓形虫病等疾病相区别 。
夏季多发 ，呈地方流行性 ，病程短 ，在猪群中传染较慢 ，发病率和死亡率比猪瘟低 。体温很高 ，但仍有一定食欲。皮肤上的红斑指压退色 ，病程较长时皮肤上有紫红色疹块 。眼睛清亮有神 ，步态僵硬 ，很少发生腹泻 。死后剖检 ，胃和小肠有严重的出血性炎症 ，脾脏肿大 ，呈樱桃红色 ，淋巴结和肾淤血肿大 ，淋巴结切面不呈大理石斑纹 ，大肠粘膜无显著变化 。病原为猪丹毒杆菌 ，青霉素治疗有效 。
最急性猪肺疫
夏季或气候 、饲养条件剧变时多发 ，呈流行性 ，发病率和病死率比猪瘟低 ，咽喉部急性肿胀 ，呼吸困难 ，口鼻流泡沫 ，有咳嗽 ，皮肤发红 ，或有少数出血点 。剖检肉眼可见咽候部肿胀出血 ，肺充血水肿 ，颌下淋巴结出血 、切面呈红色，脾不肿大 。病原为猪巴氏杆菌 ，抗菌药物治疗有效 。
败血性链球菌病
多见仔猪发病 。常有多发性关节炎和脑膜炎症状 ，病程短 。剖检肉眼可见各器官充血 、出血明显 ，心包液增量 ，脾肿大 。有神经症状的病例 ，脑和脑膜充血 、出血 ，脑脊髓液增量 、浑浊 ，脑实质有化脓性脑炎变化 。病原为溶血性链球菌 ，抗菌药物治疗有效 。
急性猪副伤寒
多见2～4月龄猪发病 ，在阴雨连绵季节多发 ，一般呈散发 。先便秘后下痢 ，有时粪便带血 ，有结膜炎 ，胸腹部皮肤呈蓝紫色 。剖检肠系膜淋巴结显著肿大 ，肝可见黄色或灰色小点状坏死 ，大肠有溃疡 ，脾肿大 。病原为猪沙门氏菌 ，氯霉素和磺胺类药物治疗有效 。
弓形虫病
主要发生于架子猪 ，流行于夏秋炎热季节 。剖检脾肿大 ，肝有散在出血点和坏死点 ，淋巴结肿大 ，有出血点和坏死点 ，脑实质充血 、水肿 、坏死 ，可区别于猪瘟 。病原为弓形虫 ，磺胺类药物治疗有效 。
此外 ，猪瘟引起母猪的繁殖障碍应注意与猪细小病毒病 、猪伪狂犬病 、猪乙型脑炎 、猪繁殖与呼吸综合症 、弓形体病 、猪钩端螺旋体 、猪衣原体及猪布鲁氏菌病等疾病相区别 。
